A Speciális GIS azon szoftvereknek a csoportja, amelyek szabványos asztali számítógépeken futnak, a Desktop és a Server termékek mellett bizonyos speciális igényeket elégítenek ki. Ezek a szoftverek is földrajzi adatokkal dolgoznak, más-más céllal lettek megalkotva, de a kategóriájában mindegyik magas funkcionalitással rendelkezik. Ezek a szoftverek a következők:

• Az ArcLogistics szoftver teljeskörű megoldást kínál összetett útvonalválasztási- és ütemezési problémák kezelésére. Az ArcLogostics segítségével dinamikus útvonalterveket és menetrendet készíthetünk, amivel jelentősen csökkenthetjük költségeinket és fejleszthetjük az ügyfelek szolgáltatásait
• ArcLogistics Navigator: GPS alapú, járművekbe szánt navigációs rendszer, mely segít biztosítani azt, hogí a járművezetők az előre eltervezett útvonal és időterv alapján haladjanak. Részletek (angol)
  
• Business Analyst: telephely kiválasztás és piacelemzések
• BusinessMap: eladási terület menedzselését és adatok vizualizálását segítő eszköz. Részletek (angol)
  
• MapIt: egy szoftver és online szolgáltatások, adatok gyűjteménye térképek létrehozásához. Microsoft platformra épül. Részletek (angol)
  
• ArcGIS Server Geoportál bővítmény: Spatial Data Infrastructure (SDI) portálok létrehozását célzó platform. Részletek (angol)
  
• PLTS for ArcGIS: térképek és diagrammok készítése. Részletek (angol)
• Job Tracking for ArcGIS (JTX): munkafolyamat-menedzsment eszköz. Részletek (angol)